blob: 19c38952dd6c60229163b5990cc76d14ac0f1fb6 (
plain) (
blame)
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
|
--- make/makeall.unx.orig Sat Jul 8 04:16:35 2000
+++ make/makeall.unx Tue Oct 24 22:35:34 2000
@@ -782,3 +782,174 @@
#load $(LDFLAGS) getmuid.c medutil.c \
$(SRC11) $(SRC8) $(SRC7) $(SRC6) $(SRC5) $(SRC3) \
$(SRC2) $(SRC1) $(OTHERLIBS) -lsocket -lnsl
+
+EXE= Nentrez Psequin \
+ asn2fast asn2ff asndhuff asntool \
+ bl2seq blast.REAL blastall blastcl3 blastclust blastpgp \
+ cdscan checksub copymat \
+ ddv dosimple \
+ entrcmd errhdr fa2htgs fastacmd findspl fmerge formatdb \
+ getfeat getmesh getpub getseq gil2bin \
+ idfetch impala indexpub \
+ makemat makeset megablast \
+ ncbisort netentcf \
+ rpsblast \
+ seedtop seqtest \
+ tbl2asn testcore testobj testval \
+ udv vecscreen
+
+
+LIB= libncbi.a libncbicdr.a libncbimla.a libncbitxc2.a \
+ libnetentr.a libncbiCacc.a libncbicn3d.a libncbimmdb.a \
+ libnetblast.a libvibgif.a libncbiNacc.a libncbidesk.a \
+ libncbiobj.a libnetcli.a libvibnet.a libncbiacc.a \
+ libncbiid1.a libncbitool.a libnetcli_.a libvibrant.a
+
+
+INC= actutils.h matrix.h rpsutil.h \
+ asnblock.h mbalign.h saldist.h \
+ asncode.h mblast.h saled.h \
+ asnent2.h mbutils.h saledit.h \
+ asnfdef.h mconsist.h salfiles.h \
+ asnfeat.h mdrcherr.h salign.h \
+ asngen.h medarch.h salmedia.h \
+ asnid0.h medutil.h salogif.h \
+ asnloc.h medview.h salpacc.h \
+ asnmdrs.h mkbioseq.h salpanel.h \
+ asnmedli.h mmdb1.h salparam.h \
+ asnmime.h mmdb2.h salpedit.h \
+ asnmla.h mmdb3.h salprop.h \
+ asnneten.h mmdbapi.h salpstat.h \
+ asnproj.h mmdbapi1.h salptool.h \
+ asnprt.h mmdbapi2.h salsa.h \
+ asnpub.h mmdbapi3.h salsap.h \
+ asnpubme.h mmdbapi4.h salstruc.h \
+ asnres.h mmdbdata.h salutil.h \
+ asnseq.h mmdblocl.h samutil.h \
+ asnsset.h ncbi.h satutil.h \
+ asnsubmt.h ncbibs.h sdisplay.h \
+ asntax1.h ncbibuf.h sec.h \
+ asntaxon.h ncbicli.h seed.h \
+ bandalgn.h ncbidraw.h seg.h \
+ binary.h ncbienv.h seqanal.h \
+ biosrc.h ncbierr.h seqcons.h \
+ blast.h ncbifile.h seqfltr.h \
+ blastdef.h ncbigif.h seqgraph.h \
+ blastkar.h ncbilang.h seqgrphx.h \
+ blastpat.h ncbilcl.h seqmgr.h \
+ blastpri.h ncbimain.h seqmtrx.h \
+ blocks.h ncbimath.h seqpcc.h \
+ blstspc.h ncbimem.h seqport.h \
+ bspview.h ncbimisc.h seqscrl.h \
+ casn.h ncbimsg.h seqsub.h \
+ cdconfig.h ncbinet.h sequtil.h \
+ cdd.h ncbiopt.h shim3d.h \
+ cdentrez.h ncbiport.h simple.h \
+ cdnewlib.h ncbiprop.h simutil.h \
+ cdrgn.h ncbisam.h spell.h \
+ cdrom.h ncbisami.h splutil.h \
+ cdromlib.h ncbisgml.h sqnutils.h \
+ cn3dentr.h ncbisock.h strimprt.h \
+ cn3dmain.h ncbisort.h stsutil.h \
+ cn3dmesh.h ncbisrti.h subutil.h \
+ cn3dmodl.h ncbistd.h suggapi.h \
+ cn3dmsel.h ncbistr.h suggen.h \
+ cn3dmsg.h ncbithr.h suggest.h \
+ cn3dopen.h ncbitime.h suggslp.h \
+ cn3dsave.h ncbiurl.h sugmap.h \
+ cn3dshim.h ncbiwin.h sugprefx.h \
+ cn3dstyl.h ncbiwww.h tax0.h \
+ cn3dxprt.h netblap3.h tax1map.h \
+ codon.h netcnfg.h taxblast.h \
+ con_file.h netentr.h taxext.h \
+ con_sock.h netlib.h taxinc.h \
+ con_stateless.h netpriv.h taxon1.h \
+ con_url.h netscape.h taxuerr.h \
+ ni_asn.h taxutil.h \
+ connectn.h ni_defin.h terr.h \
+ connectr.h ni_encr.h tfuns.h \
+ connutil.h ni_error.h toasn3.h \
+ corematx.h ni_lib.h tofasta.h \
+ db_list.h ni_lib_.h tofile.h \
+ ddvclick.h ni_list.h tomedlin.h \
+ ddvcolor.h ni_msg.h toporg.h \
+ ddvcreate.h ni_net.h tree.h \
+ ddvgraph.h ni_types.h treemgr.h \
+ ddvmain.h objacces.h treeview.h \
+ ddvopen.h objalign.h treevint.h \
+ ddvpanel.h objalignloc.h tsprintf.h \
+ diagnost.h objall.h txalign.h \
+ dlogutil.h objbibli.h txclient.h \
+ document.h objblock.h txcommon.h \
+ dotmatrx.h objblst3.h udvdef.h \
+ drawingp.h objcdd.h udviewer.h \
+ drawseq.h objcode.h udvseq.h \
+ dust.h objent2.h undefwin.h \
+ dvncode.h objentr.h urkbias.h \
+ echo_asn.h objfdef.h urkcnsrt.h \
+ edutil.h objfeat.h urkdust.h \
+ ent2api.h objgen.h urkepi.h \
+ entrez.h objloc.h urkfltr.h \
+ errdefn.h objmdrs.h urkgraph.h \
+ explore.h objmedli.h urkpcc.h \
+ fea2seg.h objmgr.h urkptpf.h \
+ ffprint.h objmime.h urksigu.h \
+ findrepl.h objmla.h urktree.h \
+ fstyle.h objmmdb1.h urkutil.h \
+ fstylep.h objmmdb2.h urlquery.h \
+ ftusrstr.h objmmdb3.h utilpars.h \
+ gapxdrop.h objneten.h utilpub.h \
+ gather.h objproj.h valid.h \
+ gbfeat.h objprt.h validatr.h \
+ gbftdef.h objpub.h validerr.h \
+ gbparlex.h objpubd.h vast2cn3d.h \
+ gifgen.h objpubme.h vast2mage.h \
+ glbpic.h objres.h vast2pdb.h \
+ gphdraw.h objseq.h vastlocl.h \
+ gtrdraw.h objsset.h vastsrv.h \
+ gxydraw.h objsub.h vecscnapi.h \
+ id1.h objtax1.h vecscrn.h \
+ id1arch.h objtaxc0.h vibdefns.h \
+ id1gen.h odlbox.h vibfltr.h \
+ id1map.h panels.h vibforms.h \
+ image.h parsegb.h vibgraph.h \
+ imagelst.h pdiagnos.h vibincld.h \
+ import.h pgppop.h vibmouse.h \
+ jzcoll.h pictur3d.h vibpcc.h \
+ jzmisc.h picture.h vibprocs.h \
+ layout.h picturep.h vibrant.h \
+ lbapi.h pmfapi.h vibtree.h \
+ legend.h pobutil.h vibtypes.h \
+ list.h posit.h viewer.h \
+ lnfac.h ppict3d.h viewer3d.h \
+ lookup.h profiles.h viewerp.h \
+ lsqfetch.h prtgene.h viewmgr.h \
+ mapgene.h prtutil.h vsm.h \
+ mapmime.h prunebsc.h vsmfile.h \
+ mapmla.h pubdesc.h vsmpriv.h \
+ mappingp.h puberr.h vsmutil.h \
+ mapproj.h qblastapi.h wwwblast.h \
+ mappubme.h readdb.h \
+ maputil.h regex.h
+
+MKDIR= /bin/mkdir -p
+INSTALL_PROGRAM= /usr/bin/install -c
+
+binstall: $(EXE)
+ ${MKDIR} ${PREFIX}/bin
+ ${INSTALL_PROGRAM} -s $? /${PREFIX}/bin
+
+linstall: $(LIB)
+ ${MKDIR} ${PREFIX}/lib/ncbi
+ ${INSTALL_PROGRAM} $? ${PREFIX}/lib/ncbi
+
+iinstall::
+ ${MKDIR} ${PREFIX}/include/ncbi
+ pwd
+ cd ../include; \
+ for file in $(INC); do \
+ ${INSTALL_PROGRAM} $$file ${PREFIX}/include/ncbi; \
+ done
+
+install: linstall binstall
+
|
